تسعى الجامعة إلى تنظيم وحفظ جميع الوثائق والمحفوظات الناتجة عن مزاولة الجامعة لأعمالها بشكل يضمن سلامتها والمحافظة على سرية المعلومات التي تحتويها، وذلك إنفاذاً إلى قرار مجلس الوزراء رقم 171 بتاريخ 1409/9/11هـ والمستند إلى المرسوم الملكي رقم (م/55) وتاريخ 1409/10/23هـ المتضمن الموافقة على نظام المركز الوطني للوثائق والمحفوظات ، و إلى قرار مجلس الوزراء رقم (9) بتاريخ 1438/1/2هـ القاضي بالموافقة على الترتيبات التنظيمية لمراكز الوثائق والمحفوظات في الأجهزة الحكومية. يعمل المركز على الاهتمام بالوثائق الرسمية الناتجة عن كافة أعمال الوحدات الأكاديمية والادارية في الجامعة, وتطبيق كافة اللوائح والأنظمة والقرارات ذات العلاقة بجمع الوثائق وتنظيمها وحفظها وبما يمكن من سرعة وسهولة الرجوع إليها عند طلبها باستخدام تقنيات ونظم معلومات حديثة.
