تقوم وكالة الجامعة للدراسات العليا والبحث العلمي بدور مهم في تحقيق رسالةالجامعة، التي جاءت، بناءً على مرجعيات أكاديمية واجتماعية محلية وعالمية، لتحقق مستويات علمية وأكاديمية متقدمة، وتصل في مجال البحث العلمي إلى مصاف الجامعات الرائدة.كما تعمل على توفير بيئة جاذبة للإبداع في المخرجات التعليمية، في مجال الدراسات العليا، إذ تولي حرصها الشديد لاكتساب المعرفة، وتخريج أجيال في تخصصات مختلفة، تخدم مجتمع المنطقة، وتلبي حاجات سوق العمل في المملكة، لا سيما وأن منطقة تبوك مقبلة على مشاريع تنموية مستقبلية واسعة، مث مشروع البحر الأحمر، ومشروع مدينة نيوم، في ضوء رؤية المملكة وتسعى الوكالة إلى تجويد الإجراءات المتعلقة بعملها، ومجالسها، ولجانها العلمية، بما يحقق سرعة الإنجاز وجودة العمل، وتطبيق الخدمات الإلكترونية؛ تماشيا مع رؤية الجامعة الطامحة إلى جامعة متميزة تعليمياً على المستويين المحلي والإقليمي وفي الختام تأمل الوكالة أن تحقق أهدافها وتطلعاتها العلمية والبحثية وفيما يخص الإجراءات، إلى جانب وكالات الجامعة وعماداتها ووحداتها.​