يُعد مجلس معهد البحوث والاستشارات بجامعة تبوك الجهة العليا المشرفة على أعمال المعهد، والمسؤولة عن توجيه سياساته واعتماد خططه وضمان كفاءة أدائه المالي والإداري والتنظيمي، وفق أنظمة التعليم العالي ولوائح الجامعة. ويتولى المجلس اعتماد السياسات العامة والخطط الاستراتيجية والموازنات واللوائح التنظيمية، بما يعزز جودة الأداء والاستدامة المالية، ويدعم تطوير الخدمات البحثية والاستشارية والتدريبية. ويتكون المجلس من رئيس المجلس عميد المعهد، وعضوية وكلاء المعهد، على أن يكون أحدهم أمينًا للمجلس، إضافة إلى ثلاثة أعضاء من خارج المعهد، بما يضمن تنوع الخبرات وتعزيز الحوكمة والاستقلالية في اتخاذ القرار. كما يضطلع المجلس بدور محوري في تعزيز الشفافية، ومتابعة التقارير والأداء المؤسسي، ودعم المبادرات النوعية والشراكات الاستراتيجية، بما يسهم في تحقيق رسالة الجامعة وخدمة المجتمع. ويمثل المجلس ركيزة أساسية في ترسيخ مكانة المعهد بوصفه الذراع الاستشارية والتعاقدية لجامعة تبوك، وتعزيز أثره العلمي والتنموي.