يقع مبنى كلية الطب لشطر الطلاب في المدينة الجامعية بمساحة إجمالية تبلغ 12 مليون متر مربع، بينما يقع مبنى شطر الطالبات في وسط مدينة تبوك. وتمتاز هذه المباني بالفن المعماري الحديث، وهي مزودة بأحدث التجهيزات التعليمية والمختبرات المتقدمة.