هي إدارة عامة تنفيذية تقوم بتسهيل مهام وإختصاصات المجلس العلمي ولجانه الدائمة والمؤقتة التابعة له من خلال الإشراف المباشر على جميع الشؤون الخاصة به والتابعة له ولمنسوبيه من أعضاء هيئة تدريس وموظفين وجهات أخرى خارجية .
تنمية وتطوير الأنشطة العلمية والبحثية لأعضاء هيئة التدريس ومن في حكمهم بالجامعة والارتقاء بها إلى مصاف الجامعات العالمية المرموقة
متابعة الشؤون العلمية لأعضاء هيئة التدريس بالجامعة, وشؤون البحث العلمي والدراسات والنشر والترقية العلمية
تطوير اللوائح والانظمة ذات العلاقة للمساهمة في دفع عجلة البحث العلمي الرصين والرفع من مستواه كمّاً ونوعاً ونشر ثقافة التميز في الاداء العلمي
تعزيز الشراكة بين الجامعات وقطاعات التعليم العالي المختلفة
تعزيز الشراكة بين الجامعة والمجتمع
حماية حقوق أعضاء هيئة التدريس المتعلقة بأعمال المجلس العلمي
استخدام تقنيات المعلومات والاتصالات بشكل فاعل لتسهيل وتسريع تعاملات المجلس
تقدم أمانة المجلس العلمي عدة خدمات لأعضاء هيئة التدريس عن طريق عرضها على المجلس العلمي من تلك الخدمات : البت في قرارات تعيين أعضاء هيئة التدريس من مبتعثي الجامعة ومن غير المبتعثين، والتوصية بالترقيات العلمية لأعضاء هيئة التدريس، وكذلك قرارات النقل، والاتصال العلمي، وتحكيم الكتب، واقتراح إنشاء مراكز البحث العلمي، والتوصية بإنشاء الجمعيات العلمية، وكذلك النظر في تقاعد أعضاء هيئة التدريس، وإقرار القواعد التنفيذية، وغيرها من الأعمال ذات الاختصاص، وكذلك دراسة كل ما يُحال للمجلس العلمي من مجلس الجامعة وذلك وفق لوائح وأنظمة أعضاء هيئة التدريس ومن في حكمهم، سعيًا لتطبيق رؤية ورسالة الجامعة، ونسعى دومًا لإنجاز المعاملات بكل شفافية ويسر ... سائلين المولى عز وجل التوفيق للجميع،،،
أمين المجلس العلميد. محمد بن علي الشهري