الأمانة العامة لمجلس الجامعة هي إحدى الأجهزة المرتبطة ارتباط مباشر بوكيل الجامعة مع إشراف كامل من معالي مدير الجامعة ، ويتولى هذا الجهاز تقديم كافة الخدمات الادارية و السكرتارية اداريا وفنيا لإجتماعات مجلس الجامعة .
ووفقاً لنظام مجلس التعليم العالي والجامعات فإن المسؤول عن هذا الجهاز هو (امين مجلس الجامعة) والذي يتم تعيينه في هذا المنصب من قبل رئيس المجلس(معالي وزير التعليم العالي) بناء على ترشيح المجلس لأحد اعضائة لتولي مهام هذا المنصب .ويصدر بتلك الموافقة قرار من المجلس نفسه . وله من الصلاحيات ما يفوض لسعادته بموجب قرار تفويض الصلاحيات الذي يصدره معالي مدير الجامعة